Theo báo cáo của Cục Hải quan TP. Hồ Chí Minh phát hành ngày 12/01/2017 tại lễ tổng kết 2016, triển khai nhiệm vụ 2017, kim ngạch xuất nhập khẩu xăng dầu trong năm 2016 đã giảm 2,88 tỷ đô la Mỹ do giá xăng dầu xuống thấp (có thời điểm xuống còn 32 đô la Mỹ/thùng dầu thô), khiến ngân sách giảm thu khoảng 7.000 tỷ đồng.
Tại Chi cục Hải quan cảng Sài Gòn khu vực 3, nơi nhập khẩu xăng dầu lớn nhất của TP. Hồ Chí Minh, thu ngân sách cả năm chỉ đạt 19.900 tỷ đồng, trong khi năm 2015 đạt tới 28.000 tỷ đồng.
Giá xăng dầu giảm dẫn đến số thu giảm là một trong những nguyên nhân chính tác động mạnh đến số thu cả năm của Cục Hải quan TP. Hồ Chí Minh, không đạt chỉ tiêu pháp lệnh.
Bên cạnh yếu tố này còn là việc các dòng thuế ưu đãi (MFN) và ưu đãi đặc biệt tiếp tục giảm từ 1 đến 3 điểm phần trăm, có những dòng thuế đã về 0%. Việc giảm thuế đã khiến ngân sách mất khoảng 130 tỷ đồng mỗi tháng, cả năm 2016 giảm thu 1.800 tỷ đồng.
Ngoài ra, có một số nguyên nhân chủ quan như tồn 1.300 chiếc ô tô nhập khẩu cuối năm.
Cả năm 2016, Cục Hải quan TP. Hồ Chí Minh thu từ hoạt động xuất nhập khẩu được khoảng 101.158 tỷ đồng, đạt 98,69% dự toán (102.500 tỉ đồng), tăng 7,69% so với năm 2015, chiếm 37,15% trên tổng số thu của toàn ngành.
