Các chất thải của thuốc BVTV bao gồm: Các dụng cụ chứa thuốc (thùng phi, bao bì, chai lọ…) nước rửa các loại dụng cụ trong quá trình pha chế và sử dụng, thuốc BVTV đã pha chế không dùng hết, thuốc BVTV hết hạn sử dụng, thuốc BVTV ngoài danh mục được phép sử dụng, lượng thuốc bị rò rỉ hoặc các chất bẩn sau khi xử lý rò rỉ của thuốc BVTV…
Các chất thải của thuốc BVTV tiềm ẩn nhiều nguy cơ đối với môi trường, hệ sinh thái và sức khỏe con người. Vì vậy theo qui định, khi xử lý các chất thải của thuốc BVTV cần phải tuân thủ đầy đủ các nguyên tắc theo qui định của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn. Nhưng trên thực tế, trong quá trình canh tác trong sản xuất nông nghiệp hiện nay, sau khi sử dụng các loại thuốc BVTV để phun phòng trừ sâu, bệnh, cỏ dại… gây hại cây trồng, người nông dân chưa có ý thức để bảo vệ môi trường. Điều dễ nhận thấy là sau khi phun thuốc BVTV, họ sẵn sàng vứt bỏ các loại bao bì, chai lọ chứa các hóa chất BVTV độc hại ở bất cứ đâu (như trên đồng ruộng, mương máng, ao, hồ…). Bên cạnh đó, các loại thuốc BVTV đã pha không dùng hết được người nông dân vô tư đổ ra môi trường xung quanh mà không hiểu được hậu quả đối với sức khỏe con người và môi trường sống. Các loại dụng cụ pha chế thuốc và bình bơm thuốc BVTV, sau khi phun xong được người nông dân vô tư rửa ở bất cứ nơi đâu miễn là có nguồn nước…. Những hoạt động đó của người nông dân đã trực tiếp hủy hoại môi trường sống và sức khỏe cộng đồng.
Vì vậy, công tác nâng cao ý thức của người dân đối với môi trường sống khi sử dụng các hóa chất BVTV trong phòng trừ dịch hại cây trồng ngoài đồng ruộng và quá trình xử lý sâu mọt hại kho bảo quản nông sản hiện nay là việc làm mang tính cấp bách nhằm bảo vệ môi trường sống, chất lượng nông sản và sức khỏe con người.