Toàn bộ nước thải của Công ty được thu gom về hệ thống xử lý nước thải và được xử lý theo phương pháp vi sinh kết hợp với lắng lọc, sau đó mới thải ra môi trường bên ngoài theo đúng quy định. Về hệ thống khí thải, Tân Hiệp Phát đầu tư xây dựng hệ thống khí thải bằng phương pháp hấp thụ và đạt tiêu chuẩn khí thải trước khi thải ra môi trường. Tập đoàn Tân Hiệp Phát được chọn là mô hình tiêu biểu của tỉnh Bình Dương về doanh nghiệp bảo vệ môi trường.