Theo thỏa thuận, Thổ Nhĩ Kỳ sẽ xóa bỏ hoặc áp dụng mức thuế suất 0% đối với 8.309 dòng thuế (gần 70%) cho các sản phẩm của Malaysia ngay sau khi FTA có hiệu lực.  Đổi lại, Malaysia cũng sẽ áp dụng thuế suất 0% cho 70% dòng thuế của Thổ Nhĩ Kỳ.

Thỏa thuận này cũng bao gồm hợp tác thông qua trao đổi chuyên gia kỹ thuật và chia sẻ kiến thức-công nghệ trong lĩnh vực các doanh nghiệp vừa và nhỏ, lĩnh vực liên quan đến ngành công nghiệp halal (thực phẩm cho người Hồi giáo), nông nghiệp và công nghiệp thực phẩm, nghiên cứu phát triển và đổi mới, y tế (dược phẩm, an toàn thực phẩm và dinh dưỡng), nguồn năng lượng và năng lượng tái tạo, thương mại điện tử và ôtô.

Thỏa thuận này được hy vọng sẽ là chất xúc tác nhằm thúc đẩy thương mại song phương của Thổ Nhĩ Kỳ và Malaysia từ 1,1 tỷ USD năm 2013 lên 5 tỷ USD vào năm 2018. Malaysia và Thổ Nhĩ Kỳ sẽ bắt đầu các thủ tục phê chuẩn tương ứng sau khi FTA song phương được ký kết.

FTA sẽ chỉ có hiệu lực sau khi hai bên đã hoàn thành quá trình này.