Theo Quyết định, ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp với doanh nghiệp hoạt động trong khu kinh tế cửa khẩu thực hiện theo quy định của Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp và các văn bản hướng dẫn thi hành. Người Việt Nam và người nước ngoài trực tiếp làm việc, sản xuất kinh doanh tại khu kinh tế cửa khẩu, có thu nhập từ việc làm, sản xuất kinh doạnh tại khu kinh tế cửa khẩu thuộc diện chịu thuế thu nhập cá nhân (TNCN) theo quy định của pháp luật được giảm 50% số thuế phải nộp.
Quyết định cũng dành nhiều ưu đãi về thuế giá trị gia tăng đối với khu kinh tế cửa khẩu. Cụ thể, một số đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng gồm: hàng hóa, dịch vụ từ khu phi thuế quan thuộc khu kinh tế cửa khẩu xuất khẩu ra nước ngoài; hàng hóa, dịch vụ sản xuất và được tiêu thụ trong khu phi thuế quan thuộc khu kinh tế cửa khẩu; hàng hóa, dịch vụ nhập khẩu từ nước ngoài vào và được tiêu thụ trong khu phi thuế quan thuộc khu kinh tế cửa khẩu.
Cũng theo Quyết định này, nhà đầu tư có nhu cầu sử dụng đất trong khu kinh tế cửa khẩu làm mặt bằng sản xuất kinh doanh mà lựa chọn hình thức giao đất có thu tiền sử dụng đất thì được Nhà nước giao đất có thu tiền sử dụng đất và được miễn tiền sử dụng đất đối với dự án thuộc lĩnh vực đặc biệt ưu đãi đầu tư; giảm 50% tiền sử dụng đất phải nộp ngân sách Nhà nước đối với dự án thuộc lĩnh vực ưu đãi đầu tư và giảm 30% tiền sử dụng đất phải nộp đối với các dự án đầu tư còn lại.
UBND các tỉnh có trách nhiệm sử dụng các khoản thu tiền sử dụng đất, tiền thuê đất tại khu kinh tế cửa khẩu đề đầu tư xây dựng công trình kết cấu hạ tầng kỹ thuật và hạ tầng xã hội, công trình dịch vụ, tiện ích cần thiết phục vụ chung trong khu kinh tế cửa khẩu hoặc tạo nguồn vốn giải phóng mặt bằng cho đầu tư phát triển các khu kinh tế cửa khẩu theo quy định của pháp luật.
Quyết định này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 15/01/2014.
