Mấy năm qua, Công ty tập trung bốc xúc đất đá ở độ cao từ 200 m trở lên để mở rộng khai trường ổn định bờ mỏ. Năm 2005, Công ty tạm dừng khai thác than ở độ sâu âm 150 m. Để đảm bảo an toàn trong sản xuất, Công ty hết sức quan tâm tới công tác tuyên truyền. Nhờ vậy, cán bộ, công nhân trong Công ty đều thấy rõ lợi ích về công tác an toàn BHLĐ. Các công trường, phân xưởng đều có tiểu ban AT-BHLĐ do Thủ trưởng đơn vị và Chủ tịch Công đoàn bộ phận phụ trách. An toán – Vệ sinh viên là những người lao động trực tiếp, có tay nghề cao, am hiểu và có kinh nghiệm nghề nghiệp, nhiệt tình, gương mẫu về công tác AT-BHLĐ, được tổ sản xuất bầu chọn. Hiện nay mạng lưới an toàn VSV có 428 người, được Giám đốc Công ty ra quyết định công nhận, hàng tháng được hưởng hệ số 0,1 (mức lương tối thiểu) và được trả hàng tháng vào sổ lương theo mức độ hoàn thành công việc. Năm nào các đơn vị cũng tổ chức huấn luyện định kỳ cho công nhân lao động, đảm bảo đạt tỷ lệ 100%. Sau đợt huấn luyện, mọi người đều có bài thu hoạch, được kiểm tra, chấm điểm, ai không đạt yêu cầu phải học lại. Ngoài việc huấn luyện định kỳ, phòng An toàn còn tổ chức học tập nghiệp vụ chuyên đề nâng cao kiến thúc về công tác AT-VSLĐ-PCCN cho cán bộ và màng lưới an toàn – vệ sinh viên. Tại công trường, phân xưởng đều có các pa nô, khẩu hiệu về công tác an toàn, một số điểm đông người qua lại trên công trường có những bức pa nô rộng hàng chục mét vuông tuyên truyền về công tác an toàn. Các thiết bị đều có nội quy, quy trình, quy phạm vận hành và sử dụng. Các phương tiện cứu hỏa đặt ở những nơi thuận lợi nhất, dễ thấy, xử lý nhanh khi có sự cố xảy ra. Các dụng cụ, phương tiện về công tác kỹ thuật an toàn như ủng cách điện, sứ chống sét,… hàng năm đều được kiểm tra và bổ sung mới. Năm 2005, Công ty tổ chức cuộc thi vẽ tranh an toàn, có 132 bức tranh dự thi, đã tổ chức trưng bày cho CBCN tới thăm quan. Sau khi kết thúc cuộc thi cấp đơn vị, Công ty chọn 20 bức tranh dự thi cấp TVN, trong đó 7 tranh đạt giải khuyến khích, đơn vị đạt giải Ba. Trong cuộc thi An toàn vệ sinh viên giỏi do TVN tổ chức năm 2005, Công ty Than Cọc Sáu đạt giải nhất. Đài Truyền thanh Công ty phổ biến kịp thời các chỉ thị, nghị quyết, các quy định của lãnh đạo Công ty về công tác AT-BHLĐ, biểu dương các tập thể, cá nhân có thành tích và phê phán những cá nhân vi phạm quy trình, quy phạm kỹ thuật an toàn, các tập thể để xảy ra tai nạn. Công ty ban hành quy chế thi đua, có chấm điểm xếp loại hàng quý, hàng năm cho các đơn vị và có tiêu chuẩn bình xét danh hiệu thi đua hàng năm để cá nhân phấn đấu. Những tập thể, cá nhân vi phạm quy trình, để xảy ra tai nạn đều bị xử lý kỷ luật và thông báo rộng rãi tới tất cả CBCN trong Công ty biết để rút kinh nghiệm.
Với đặc thù khai thác than lộ thiên xuống sâu thấp hơn mực nước biển, Công ty đã có nhiều biện pháp nâng cao năng suất thiết bị và đảm bảo an toàn trong quá trình sản xuất, đặc biệt trong công tác làm đường mỏ. Từ lâu Công ty đã áp dụng cơ giới hóa làm đường. Tất cả các tuyến đường được bố trí khoa học, giảm mật độ xe hoạt động trên đường. Các tuyến đường được thi công rộng, bằng phẳng và có bờ chắn đảm bảo an toàn, cua đường được mở rộng, hạn chế gấp khúc. Những nơi dễ xảy ra tai nạn đều có biển báo để mọi người phòng tránh. Mùa khô, Công ty bố trí đủ xe tưới nước, dập bụi. Vào những ngày mưa phùn sương mù và thời kỳ sản xuất cao điểm, phòng An toàn phối hợp với phòng điều khiển sản xuất tăng cường công tác kiểm tra, điều phối thiết bị tham gia sản xuất hợp lý, giảm chi phí cho sản xuất và đảm bảo an toàn cho người và thiết bị. Các tuyến đường được giao cho từng máy gạt quản lý, xử lý nhanh các đoạn đường bị hỏng hoặc bị trơn lầy. Các tuyến mương thoát nước được gia cố, hạn chế không cho nước chảy xuống lòng moong và làm hư hỏng đường. Tại các đầu đường, bãi thải có đủ điện chiếu sáng, các xe gạt thường xuyên hoạt động, san gạt bằng phẳng, bờ cơi đảm bảo các thông số kỹ thuật theo quy định. Công nhân chỉ đường được trang bị đầy đủ bảo hộ chuyên dùng, ban đêm có áo và cờ phản quang giúp lái xe dễ nhận biết và thực hiện đổ tải theo đúng hướng dẫn, nhờ đó mấy năm qua không có vụ tai nạn nào xảy ra. Năm 2005, Công ty tổ chức khám sức khoẻ định kỳ cho toàn thể CBCN, đạt tỷ lệ 99,8%, khám sức khoẻ lần 2 cho 1.272 người làm việc trong môi trường độc hại dễ mắc bệnh nghề nghiệp. Sau khi khám sức khoẻ, trạm y tế tiến hành phân loại sức khoẻ, cấp thuốc và các chế độ bồi dưỡng, đồng thời tổ chức cho những người mắc bệnh đi khám và chữa bệnh ở các bệnh viện tuyến trên. Tại các đơn vị sản xuất, trên công trường đều có các tủ thuốc thông dụng để CBCN sử dụng khi cần thiết. Trạm y tế bố trí 2 địa điểm ở khu vực đông người làm nhiệm vụ cấp cứu, sơ cứu ban đầu. Công ty bố trí 1 xe cứu thương loại tốt thường trực 24/24 giờ, có đủ thuốc và phương tiện cấp cứu khi có sự cố xảy ra. Tại trạm y tế có 20 giường phục vụ công tác theo dõi và điều trị bệnh nhân mắc bệnh nhẹ, thông thường, chữa trị ít ngày. Hàng quý, y, bác sỹ của trạm đến tận các đơn vị sản xuất khám bệnh, cấp thuốc cho CNVC. Sau khi tổ chức khám sức khoẻ định kỳ và tổ chức theo dõi sức khỏe cho người lao động, Công ty cho nghỉ dưỡng sức để phục hồi sức khỏe cho 814 người, trong đó bố trí nghỉ tập trung 6 đợt cho 270 người và nghỉ tại chỗ cho 544 người, với số tiền 352 triệu đồng. Trong năm, Công ty thực hiện chế độ bồi dưỡng nghề, công việc nặng nhọc, độc hại bằng hiện vật cho 3.000 người với số tiền trị giá trên 4,2 tỷ đồng. Duy trì chế độ bồi dưỡng cho chị em khi nghỉ thai sản, mỗi người 300.000 đồng. Tại các phân xưởng có bãi rửa xe, tạo điều kiện cho lái xe tổ chức làm vệ sinh công nghiệp, giữ cho xe luôn sạch đẹp. Khu điều hành của các đơn vị được xây dựng thoáng mát, hợp vệ sinh và có vườn hoa cây cảnh, xung quanh được trồng cây xanh tạo nên cảnh quan môi trường xanh – sạch - đẹp.
Phát huy thành tích đã đạt được, năm 2006, trong điều kiện sản xuất còn gặp nhiều khó khăn, CBCN Công ty Than Cọc Sáu đã phát động thi đua với mục tiêu: “An toàn - Đổi mới – Phát triển – Hiệu quả”, phấn đấu bốc xúc 24,8 triệu m3 đất đá, than nguyên khai 3 triệu tấn, doanh thu sản xuất than đạt trên 977 tỷ đồng, lập thành tích chào mừng đại hội Đảng toàn quốc lần thứ X.