Quy hoạch thị xã Phủ Lý giai đoạn 1997 - 2000 và quy hoạch phát triển kinh tế - xã hội Thị xã giai đoạn 2000 – 2010, định hướng đến 2020 được các cấp, các ngành quan tâm, đã xác định hướng đi là: Thị xã phải có tốc độ tăng trưởng kinh tế cao, là đầu tàu và trung tâm kinh tế vùng, với cơ cấu theo hướng phát triển CNH, HĐH, coi trọng đầu tư đồng bộ, từng bước hiện đại hóa hạ tầng xã hội, phát triển không gian phù hợp, là thành phố vệ tinh phía Nam Thủ đô Hà Nội với hướng thương mại, dịch vụ, công nghiệp – nông nghiệp phát triển bền vững. Gắn phát triển kinh tế với củng cố quốc phòng - an ninh, trong đó xác định cơ cấu kinh tế của Thị xã theo hướng phát triển thương mại, dịch vụ, công nghiệp, nông nghiệp, trong đó thương mại, dịch vụ là mũi nhọn, là khâu đột phá để tích lũy vốn cho đầu tư phát triển
Thời gian qua, quán triệt sâu sắc chủ trương, Nghị quyết của Trung ương, của Tỉnh, Thị xã đã phối hợp chặt chẽ với các cấp, các ngành trong Tỉnh, phát huy có hiệu quả các nguồn lực, tăng cường thu hút đầu tư, tập trung đẩy mạnh chuyển dịch cơ cấu kinh tế theo hướng tăng tỷ trọng dịch vụ, công nghiệp, đẩy nhanh tiến độ xây dựng và phát triển đô thị. Đến nay, công nghiệp, tiểu thủ công nghiệp, dịch vụ, thương mại trên địa bàn Thị xã Phủ Lý phát triển khá nhanh, cả về số lượng và chất lượng. Các cấp, các ngành từ Thị xã đến cơ sở luôn quan tâm, theo dõi, chỉ đạo, tạo mọi điều kiện thuận lợi để các cơ sở kinh doanh được ổn định, khuyến khích đầu tư mở rộng và phát triển sản xuất - kinh doanh. Năm 2004, Thị xã chỉ có 190 doanh nghiệp, đến năm 2005 có 288 doanh nghiệp, 71 chi nhánh và công ty, 4.072 các hộ sản xuất kinh doanh, 16 mô hình kinh tế trang trại đã và đang đi vào hoạt động. Ngoài ra, Thị xã rất chú trọng đến việc thu hút các nhà đầu tư vào các khu công nghiệp, các cụm tiểu thủ công nghiệp như KCN Châu Sơn… Giá trị sản xuất công nghiệp, tiểu thủ công nghiệp Thị xã đã đạt được một số kết quả đáng mừng, năm sau cao hơn năm trước, nhiều mặt hàng được khách hàng trong và ngoài nước tín nhiệm như: Hàng dệt, may của Công ty Dệt Hà Nam, Công ty Đầu tư Hà Nam, Công ty Cổ phần XNK 277, Công ty Hapitex, hàng bột nhẹ của Công ty Đức Tài, Công ty Liên doanh Khoáng sản Nam Thiên Sơn, Công ty Trí Hường… và các mặt hàng cơ khí khung nhôm của Công ty Minh Lực, gạch blốc của Công ty Xây dựng Hà Nam. Các mặt hàng mới như máy tính, truyền hình, cáp quang, lắp ráp điện tử, điện lạnh đang hình thành và từng bước phát triển như Công ty ánh Dương, á Đại Lợi... 6 tháng đầu năm, giá trị sản xuất công nghiệp, tiểu thủ công nghiệp đạt 58,5% kế hoạch năm, tăng 24,2% so với cùng kỳ năm 2004; tổng mức luân chuyển hàng hóa và doanh thu dịch vụ trên địa bàn đạt 53% kế hoạch năm, tăng 39,5% so với cùng kỳ năm 2004.
Có thể nói, sản xuất công nghiệp, tiểu thủ công nghiệp thị xã Phủ Lý đã có những bước phát triển đáng kể, song do xuất phát điểm, bước đi ban đầu của Thị xã quá thấp, do vậy, hiện nay, Thị xã vẫn còn những khó khăn, cụ thể: các cơ sở còn nhỏ bé, thiết bị công nghệ còn lạc hậu, khả năng cạnh tranh của sản phẩm trên thị trường chưa cao. Để khắc phục được những hạn chế, đạt được những mục tiêu đề ra, Thị xã sẽ đẩy mạnh công tác thông tin tuyên truyền để nâng cao nhận thức của cán bộ, đảng viên và nhân dân trong việc xây dựng Thị xã văn minh, giàu đẹp; tạo điều kiện thu hút đầu tư vào Thị xã thông qua việc cải cách hành chính, ban hành cơ chế chính sách, khuyến khích các nhà đầu tư; tăng cường công tác quản lý, nhất là quản lý đô thị; tập trung xây dựng đội ngũ cán bộ, công chức có trình độ năng lực và đạo đức, đáp ứng được yêu cầu trong tình hình mới.
