Riêng tại khu di tích - danh thắng Yên Tử có số lượng Cây di sản lớn nhất trong toàn tỉnh với tổng số 144 cây, đã được công nhận từ năm 2016. Cụ thể gồm 102 cây xích tùng, 21 cây mai vàng, 10 cây thông nhựa, 9 cây đại, 1 cây thị và 1 cây đa tía.
Các cây di sản đều có tuổi đời khá cao, nhiều cây có tuổi đời từ 300-700 năm nhưng lại gần gũi, quen thuộc với du khách khi về với Yên Tử, bởi chúng hiện diện nhiều trên các tuyến hành hương và các điểm chùa, am, tháp của di sản.
Trên tuyến đường bộ từ chùa Giải Oan lên tới tháp Tổ Huệ Quang, xích tùng được trồng theo hàng tạo thành con đường tùng tuyệt đẹp. Còn những cây đại cổ thì được trồng nhiều cả ở chùa Giải Oan, khu tháp Tổ cho tới khu vực chùa Hoa Yên. Du khách vừa dâng hương vừa có thể chiêm ngưỡng những cây đại sum suê nơi đây với sắc thái khác biệt theo mùa, khi trơ trụi, mốc thếch xù xì, lúc lại tươi tốt xanh tươi, nở đầy hoa toả hương thơm đặc trưng.
Những cây mai Yên Tử mọc trên các sườn núi, hay hình ảnh “2 trong 1” của cây đa “ôm” cây thị độc đáo bên cạnh tháp Tịnh Quang. Cây cao, đẹp với hệ rễ phụ vươn dài rất hùng vĩ đã gây ấn tượng đặc biệt với du khách khi dừng chân ở khu vực chùa Lân - Thiền viện Trúc Lâm Yên Tử.
Các Cây di sản của Yên Tử đều không phải cây mọc tự nhiên, tương truyền là do các thiền sư khi về tu tập đã trồng tại Yên Tử từ hàng trăm năm trước, trên các tuyến đường hành hương và xung quanh khuôn viên các di tích. Với sức sống mãnh liệt, ý nghĩa sâu xa, các loại cây được xem như biểu tượng của Phật giáo Trúc Lâm, nhắc nhớ về sự hình thành và phát triển của dòng thiền này ở Yên Tử. Gắn với sự trường tồn của Yên Tử, những cây cổ này trải qua thời gian đã mang trong mình những giá trị văn hoá, trở thành một phần quan trọng, không thể thiếu của di sản.
Với 144 cây di sản được công nhận cùng lúc khi ấy, Quảng Ninh có lẽ là tiền lệ hiếm trong cả nước. Kể từ đó cho tới đầu năm 2023, Quảng Ninh mới lại có 1 cây si và 1 cây đa có tuổi đời hơn 350 năm ở xã Phong Dụ (huyện Tiên Yên), được công nhận danh hiệu này.
Gần đây nhất, vào đầu tháng 3 vừa qua, TP Cẩm Phả, huyện Vân Đồn tiếp tục có 16 Cây di sản được công nhận. Trong đó có 2 cây đa, 9 cây nhãn và 1 cây long não trong khuôn viên Khu di tích lịch sử quốc gia đặc biệt đền Cửa Ông - Cặp Tiên; 3 cây thông và 1 cây trám cổ tại miếu Ba Cây Thông, xã Dương Huy.
Nổi tiếng, được nhiều người biết tới là khu rừng trâm trên đảo Minh Châu, huyện Vân Đồn. Rừng trâm có diện tích trên 3,4ha với cả trăm cây sống quần tụ bao quanh đảo, ước tuổi đời lên đến khoảng 300 năm. Những cây trâm khoẻ khoắn đan cài vào nhau, cùng nhau chắn gió bão, chắn cát, chắn sóng biển để bảo vệ vùng đất liền của cư dân phía trong, một thời còn cứu đói người dân xã đảo.
Cây di sản chỉ là một danh hiệu được Hội Bảo vệ thiên nhiên và môi trường Việt Nam cấp bằng công nhận có thể xem chính là vốn quý cho phát triển du lịch sinh thái tại các địa phương, góp phần gia tăng giá trị các khu di sản, đã được nhiều địa phương trong cả nước quảng bá, thu hút du khách tương đối tốt trong đó có Quảng Ninh.