Nhiệm vụ chủ yếu của Văn phòng là:
1. Đề xuất cơ chế, chính sách, giải pháp bảo vệ môi trường, phát triển bền vững ngành Công nghiệp để Vụ trưởng Vụ Khoa học Công nghệ trình Bộ trưởng ban hành hoặc trình Thủ tướng Chính phủ ban hành.
2. Tổ chức hướng dẫn, triển khai thực hiện chiến lược, qui hoạch, kế hoạch về bảo vệ môi trường trong ngành Công nghiệp.
3. Đầu mối về tổ chức mạng lưới bảo vệ môi trường trong các cơ quan, đơn vị, doanh nghiệp thuộc Ngành để thực hiện mục tiêu bảo vệ môi trường, phát triển công nghiệp bền vững.
4. Phối hợp với các cơ quan quản lý nhà nước, tổ chức nghiên cứu khoa học – công nghệ và địa phương trong việc giám sát, phát hiện, giải quyết những vấn đề phát sinh về ô nhiễm môi trường trong công nghiệp; tham gia thẩm định, đánh giá tác động môi trường.
5. Tổ chức bồi dưỡng nâng cao nhận thức về kỹ năng bảo vệ môi trường trong hoạt động của các cơ quan, đơn vị, doanh nghiệp công nghiệp; cập nhật, giới thiệu và phổ biến những thông tin mới, kỹ năng mới, công cụ mới phục vụ công tác bảo vệ môi trường.
6. Đầu mối hợp tác về xây dựng, triển khai thực hiện các chương trình dự án tài trợ của các tổ chức quốc tế về lĩnh vực bảo vệ môi trường thuộc ngành CN.
7. Chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng Bộ Công nghiệp và Vụ trưởng Vụ Khoa học Công nghệ về công tác bảo vệ môi trường trong ngành Công nghiệp.
Điều hành Văn phòng là Chánh Văn phòng do Phó Vụ trưởng Vụ Khoa học Công nghệ kiệm nhiệm và giúp việc Chánh Văn phòng gồm một số công chức kiêm nhiệm của Vụ Khoa học Công nghệ do Vụ trưởng phân công. Văn phòng được sử dụng con dấu của Bộ Công nghiệp và tài khoản của Văn phòng Bộ Công nghiệp để hoạt động và giao dịch theo qui định của Bộ trưởng Bộ Công nghiệp.
